生物在线小工具汇总
annuogene
2018-01-25 14:42

一直在寻找生物在线工具的小伙伴们福利来啦,小编整理了多款在线小工具,小伙伴们赶紧收藏起来~


Promoter Scan

功能:启动子预测
网址:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan


ORF Finder

功能:ORF预测

网址:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/



tRNAScan-SE

功能:tRNA预测

网址:

https://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/


NCBI-BLAST

功能:序列比对

网址:

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi




MUSCLE

功能:运行速度比较快的多序列比对

网址:

https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#



Clustal Omega

功能:DNA、RNA、蛋白的多序列比对

网址:

https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/



ClustalW2

功能:应用较广泛的多序列比对

网址:

https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/



T-Coffee

功能:准确度高,速度慢的多序列比对

网址:

https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/



SimiTriX-SimiTetra

功能:多序列比对相似性展示

网址:

https://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php



Venn图

功能:绘制Venn图

网址:

https://www.biovenn.nl/index.php



功能:绘制Venn图

网址:

https://bioinformatics.psb.ugent.be/cgi-bin/liste/Venn/calculate_venn.htpl 



功能:绘制Venn图

网址:

https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html


WEGO

功能:绘制GO注释结果图 

网址:

https://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl



CIRCOS

功能:绘制圈图

网址:

https://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/



CIRCexplorer

功能:进行circRNA分析

网址:

https://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/



iPath

功能:进行可视化通路图在线分析

网址:

https://pathways.embl.de/



Genome Scope

功能:进行基因组杂合度评估

网址:

https://qb.cshl.edu/genomescope/



UCSC

功能:进行基因组可视化

网址:

https://genome.ucsc.edu/index.html



IBS

功能:进行序列结构示意图绘制

网址:

https://ibs.biocuckoo.org/online.php


以上是小编汇总的生物在线工具,功能、网址都已备好,赶紧收藏,有了它再也不用愁找不到对应的小工具啦~